Here is a list of all documented file members with links to the documentation:

- a -

• addEICPeak() : cSummaryPeaksTableWidget.h
• addStringFormulaToMap() : cSummaryFormula.h
• appname : utilities.h
• appversion : utilities.h

- c -

• calculateBaseTau() : cChromatogramWindowWidget.h
• calculateCaruana() : cChromatogramWindowWidget.h
• calculateExponentialParameters() : cChromatogramWindowWidget.h
• calculateGaussianParameters() : cChromatogramWindowWidget.h
• calculateGuo() : cChromatogramWindowWidget.h
• calculateLineParameterA() : cMultipleDatasetsTableWidget.h
• calculateLineParameters() : cMultipleDatasetsTableWidget.h
• calculateLineParametersWithIterations() : cMultipleDatasetsTableWidget.h
• calculateLOD() : cCalibrationChartScene.h
• calculateLOQ() : cCalibrationChartScene.h
• calculateR2Value() : cCalibrationChartScene.h
• calculateTauUsingWeightedAverage() : cChromatogramWindowWidget.h
• charge() : cFragmentIons.h
• checkAdvancedFilteringRules() : cParameters.h
• checkFile() : utilities.h
• checkRegex() : utilities.h
• checkSeniorRules() : cParameters.h
• compareBandAllIonsDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareBrickMasses() : cBricksDatabase.h
• compareCosineSimilarityDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareDoubles() : utilities.h
• compareEdgesByPPMError() : cDeNovoGraphNode.h
• compareEdgesByTargetNodeIntensityDesc() : cDeNovoGraphNode.h
• compareElementTagName() : cMzML.h
• compareHints() : cParameters.h
• compareMapsIntDouble() : utilities.h
• compareNodes() : cDeNovoGraph.h
• compareNumberOfMatchedPeaksDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• comparePaths() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareRelativePeakIntensitiesDesc() : cPeaksList.h
• compareStringVectors() : utilities.h
• compareSumOfRelIntDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareWeightedRatioDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareYandAllIonsDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• compareYBandAllIonsDesc() : cSpectrumComparatorThreadMS2.h
• computeExponentialFunction() : cChromatogramWindowWidget.h
• computeExponentiallyModifiedGaussFunction() : cChromatogramWindowWidget.h
• computeGaussFunction() : cPatternSimulatorSceneWidget.h
• computeGaussHeight() : cPatternSimulatorSceneWidget.h
• convertStringIntUnorderedMapToStringVector() : utilities.h
• cropDecimalsByteArray() : utilities.h
• cropPrecisionToSixDecimals() : utilities.h
• cropPrecisionToSixDecimalsByteArray() : utilities.h

- d -

• defaultneutrallosses : cFragmentIons.h
• defaultwinsizex : utilities.h
• defaultwinsizey : utilities.h
• drawLabels() : cLinearWidget.h

- e -

• eChannelType : cImageWindowTabOptical.h
• econst : utilities.h
• eCursorActivityType : cImageWindowWidget.h
• eFragmentIonType : cFragmentIons.h
• eModeType : utilities.h
• ePeakListFileFormat : cParameters.h
• ePeptideType : utilities.h
• eResidueLossType : cBrick.h
• erfcx() : cChromatogramWindowWidget.h
• erfcxinv() : cChromatogramWindowWidget.h
• eScoreType : cParameters.h
• eVendorType : utilities.h

- f -

• fact() : utilities.h
• fixLabelCharge() : utilities.h

- g -

• generateBranchLabelsDown() : cBranchCyclicWidget.h
• generateBranchLabelsUp() : cBranchCyclicWidget.h
• generateBricksPermutations() : cBricksDatabase.h
• generateCyclicLabelsToLeft() : cCyclicWidget.h
• generateCyclicLabelsToRight() : cCyclicWidget.h
• getAttribute() : cMzML.h
• getExponentiallyModifiedGaussianArea() : cChromatogramWindowWidget.h
• getExponentiallyModifiedGaussianAreas() : cChromatogramWindowWidget.h
• getGaussianArea() : cChromatogramWindowWidget.h
• getGaussianAreas() : cChromatogramWindowWidget.h
• getNameOfCompositionFromIntVector() : cBricksDatabase.h
• getNumberOfBricks() : cBrick.h
• getNumberOfScoreHits() : cTheoreticalSpectrum.h
• getPeptideTypeFromString() : utilities.h
• getReversedNameOfCompositionFromStringVector() : cBricksDatabase.h
• getShortFileName() : utilities.h
• getStringFromPeptideType() : utilities.h

- i -

• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfBranchCyclicPeptides() : cFragmentIons.h
• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfCyclicPeptides() : cFragmentIons.h
• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfCyclicPolyketide() : cFragmentIons.h
• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfLinearPeptides() : cFragmentIons.h
• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfLinearPolyketide() : cFragmentIons.h
• initializeFragmentIonsForDeNovoGraphOfTPeptides() : cFragmentIons.h
• insertLabel() : cLinearWidget.h
• installdir : utilities.h
• isCompatibleVersion() : utilities.h
• isInPpmMassErrorTolerance() : cPeaksList.h
• isotopemap : cFragmentIons.h
• isotopepatterncache : cMainThread.h
• isWhiteSpace() : utilities.h
• isWhiteSpaceExceptSpace() : utilities.h

- l -

• lastcompatibleappversion : utilities.h
• loadDoubleVector() : utilities.h
• loadIntStringMap() : utilities.h
• loadIntVector() : utilities.h
• loadModificationsFromPlainTextStream() : cFragmentIons.h
• loadString() : utilities.h
• loadStringIntMap() : utilities.h
• loadStringIntMapVector() : utilities.h
• loadStringVector() : utilities.h

- m -

• maximumcandidates : cDeNovoGraph.h
• median() : utilities.h
• mergeMaps() : cSummaryFormula.h

- n -

• numberoflayers : cImageWindowWidget.h
• numberOfOccurrences() : cBricksDatabaseWidget.h

- o -

• operator==() : cCandidate.h, cDeNovoGraphNode.h, cLinearWidget.h

- p -

• paintCircle() : cCyclicWidget.h
• parseBranch() : utilities.h
• parseLifMetadata() : cImageWindowTabOptical.h
• parseLifMetadataSubTree() : cImageWindowTabOptical.h
• periodictablemap : cFragmentIons.h
• pi : utilities.h
• ppmError() : cPeaksList.h
• proxyModelCheckDouble() : utilities.h
• proxyModelCheckInt() : utilities.h
• proxyModelCheckString() : utilities.h

- q -

• Q_DECLARE_METATYPE() : cFragmentIons.h, cParameters.h, cPeaksList.h, utilities.h, cMainWindow.h

- r -

• readLifMetadata() : cImageWindowTabOptical.h
• rechargeMap() : cSummaryFormula.h
• reduceMapToStringFormula() : cSummaryFormula.h
• removeWhiteSpacesExceptSpaces() : utilities.h

- s -

• searchHint() : cPeaksList.h
• searchHintForDeNovo() : cParameters.h
• setAttribute() : cMzML.h
• storeDoubleVector() : utilities.h
• storeIntStringMap() : utilities.h
• storeIntVector() : utilities.h
• storeModificationsToPlainTextStream() : cFragmentIons.h
• storeString() : utilities.h
• storeStringIntMap() : utilities.h
• storeStringIntMapVector() : utilities.h
• storeStringVector() : utilities.h
• stripHTML() : utilities.h
• stripIsomers() : utilities.h
• stripIsomersFromStringVector() : utilities.h

- u -

• uncharge() : cFragmentIons.h